Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gjb5Q02739 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gjb5Q02739 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gjb5Q02739 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms