Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PrkcqQ02111 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PrkcqQ02111 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PrkcqQ02111 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms