Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ly9Q01965 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ly9Q01965 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ly9Q01965 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms