Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RykQ01887 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RykQ01887 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RykQ01887 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RykQ01887 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RykQ01887 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RykQ01887 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RykQ01887 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RykQ01887 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RykQ01887 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RykQ01887 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RykQ01887 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RykQ01887 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RykQ01887 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RykQ01887 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RykQ01887 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RykQ01887 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RykQ01887 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RykQ01887 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RykQ01887 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RykQ01887 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RykQ01887 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RykQ01887 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RykQ01887 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RykQ01887 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RykQ01887 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RykQ01887 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RykQ01887 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RykQ01887 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RykQ01887 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RykQ01887 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RykQ01887 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RykQ01887 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RykQ01887 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RykQ01887 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RykQ01887 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RykQ01887 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RykQ01887 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RykQ01887 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RykQ01887 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RykQ01887 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RykQ01887 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RykQ01887 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RykQ01887 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RykQ01887 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RykQ01887 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RykQ01887 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RykQ01887 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RykQ01887 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RykQ01887 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RykQ01887 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RykQ01887 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RykQ01887 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RykQ01887 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RykQ01887 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RykQ01887 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RykQ01887 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RykQ01887 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RykQ01887 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RykQ01887 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RykQ01887 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RykQ01887 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RykQ01887 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RykQ01887 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RykQ01887 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RykQ01887 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RykQ01887 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RykQ01887 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RykQ01887 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RykQ01887 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RykQ01887 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RykQ01887 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RykQ01887 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RykQ01887 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RykQ01887 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RykQ01887 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RykQ01887 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RykQ01887 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RykQ01887 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RykQ01887 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RykQ01887 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RykQ01887 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RykQ01887 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RykQ01887 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RykQ01887 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RykQ01887 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RykQ01887 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RykQ01887 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RykQ01887 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RykQ01887 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RykQ01887 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RykQ01887 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RykQ01887 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RykQ01887 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RykQ01887 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RykQ01887 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RykQ01887 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RykQ01887 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RykQ01887 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RykQ01887 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms