Protein–RNA interactions for Protein: Q01853

Vcp, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcpQ01853 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VcpQ01853 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VcpQ01853 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VcpQ01853 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
VcpQ01853 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VcpQ01853 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VcpQ01853 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VcpQ01853 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
VcpQ01853 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms