Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nme2Q01768 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nme2Q01768 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms