Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mc1rQ01727 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mc1rQ01727 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mc1rQ01727 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms