Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gbp1Q01514 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gbp1Q01514 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gbp1Q01514 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms