Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmgcrQ01237 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HmgcrQ01237 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HmgcrQ01237 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HmgcrQ01237 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms