Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col1a2Q01149 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Col1a2Q01149 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Col1a2Q01149 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms