Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Pde1bQ01065 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pde1bQ01065 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pde1bQ01065 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms