Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gjb2Q00977 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gjb2Q00977 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms