Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbp1Q00915 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rbp1Q00915 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms