Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Serpina1cQ00896 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Serpina1cQ00896 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms