Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PgrQ00175 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PgrQ00175 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PgrQ00175 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PgrQ00175 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PgrQ00175 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PgrQ00175 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PgrQ00175 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PgrQ00175 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PgrQ00175 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PgrQ00175 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PgrQ00175 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PgrQ00175 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PgrQ00175 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PgrQ00175 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PgrQ00175 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PgrQ00175 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PgrQ00175 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PgrQ00175 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PgrQ00175 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PgrQ00175 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PgrQ00175 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PgrQ00175 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PgrQ00175 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PgrQ00175 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PgrQ00175 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PgrQ00175 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PgrQ00175 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PgrQ00175 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PgrQ00175 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PgrQ00175 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PgrQ00175 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PgrQ00175 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PgrQ00175 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PgrQ00175 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PgrQ00175 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PgrQ00175 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PgrQ00175 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PgrQ00175 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PgrQ00175 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PgrQ00175 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PgrQ00175 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PgrQ00175 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PgrQ00175 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PgrQ00175 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PgrQ00175 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms