Protein–RNA interactions for Protein: P97868

Rbbp6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp6P97868 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Rbbp6P97868 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rbbp6P97868 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rbbp6P97868 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms