Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
AlkP97793 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
AlkP97793 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
AlkP97793 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
AlkP97793 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
AlkP97793 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
AlkP97793 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
AlkP97793 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
AlkP97793 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
AlkP97793 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
AlkP97793 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
AlkP97793 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
AlkP97793 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
AlkP97793 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
AlkP97793 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
AlkP97793 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
AlkP97793 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
AlkP97793 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
AlkP97793 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
AlkP97793 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
AlkP97793 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
AlkP97793 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
AlkP97793 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
AlkP97793 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
AlkP97793 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
AlkP97793 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
AlkP97793 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
AlkP97793 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
AlkP97793 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
AlkP97793 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
AlkP97793 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
AlkP97793 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
AlkP97793 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
AlkP97793 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
AlkP97793 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
AlkP97793 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
AlkP97793 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
AlkP97793 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
AlkP97793 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
AlkP97793 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
AlkP97793 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
AlkP97793 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
AlkP97793 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
AlkP97793 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
AlkP97793 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
AlkP97793 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
AlkP97793 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
AlkP97793 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AlkP97793 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AlkP97793 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
AlkP97793 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AlkP97793 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
AlkP97793 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC29■■■□□ 2.23
AlkP97793 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC29■■■□□ 2.23
AlkP97793 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AlkP97793 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AlkP97793 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
AlkP97793 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AlkP97793 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
AlkP97793 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AlkP97793 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AlkP97793 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AlkP97793 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AlkP97793 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AlkP97793 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
AlkP97793 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AlkP97793 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
AlkP97793 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
AlkP97793 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
AlkP97793 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AlkP97793 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
AlkP97793 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AlkP97793 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
AlkP97793 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
AlkP97793 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
AlkP97793 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
AlkP97793 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
AlkP97793 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AlkP97793 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
AlkP97793 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
AlkP97793 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
AlkP97793 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
AlkP97793 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
AlkP97793 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
AlkP97793 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AlkP97793 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AlkP97793 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
AlkP97793 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AlkP97793 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AlkP97793 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AlkP97793 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AlkP97793 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
AlkP97793 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
AlkP97793 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
AlkP97793 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AlkP97793 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AlkP97793 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AlkP97793 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
AlkP97793 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
AlkP97793 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms