Protein–RNA interactions for Protein: P97433

Arhgef28, Rho guanine nucleotide exchange factor 28, mousemouse

Predictions only

Length 1,693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef28P97433 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Arhgef28P97433 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Arhgef28P97433 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arhgef28P97433 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arhgef28P97433 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arhgef28P97433 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Arhgef28P97433 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Arhgef28P97433 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Arhgef28P97433 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Arhgef28P97433 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arhgef28P97433 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arhgef28P97433 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Arhgef28P97433 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Arhgef28P97433 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Arhgef28P97433 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Arhgef28P97433 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Arhgef28P97433 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arhgef28P97433 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arhgef28P97433 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arhgef28P97433 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Arhgef28P97433 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Arhgef28P97433 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Arhgef28P97433 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Arhgef28P97433 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Arhgef28P97433 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Arhgef28P97433 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Arhgef28P97433 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Arhgef28P97433 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms