Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lig3P97386 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lig3P97386 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lig3P97386 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lig3P97386 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lig3P97386 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lig3P97386 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lig3P97386 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lig3P97386 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lig3P97386 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms