Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Pkp1P97350 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Pkp1P97350 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pkp1P97350 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms