Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H3f3aP84244 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H3f3aP84244 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H3f3aP84244 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
H3f3aP84244 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
H3f3aP84244 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3f3aP84244 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3f3aP84244 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3f3aP84244 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3f3aP84244 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
H3f3aP84244 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3f3aP84244 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3f3aP84244 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3f3aP84244 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3f3aP84244 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3f3aP84244 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3f3aP84244 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H3f3aP84244 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms