Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf1P84078 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf1P84078 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Arf1P84078 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf1P84078 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf1P84078 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf1P84078 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arf1P84078 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arf1P84078 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Arf1P84078 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms