Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 1,155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CiitaP79621 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CiitaP79621 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CiitaP79621 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CiitaP79621 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CiitaP79621 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CiitaP79621 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CiitaP79621 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CiitaP79621 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CiitaP79621 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CiitaP79621 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CiitaP79621 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CiitaP79621 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CiitaP79621 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CiitaP79621 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CiitaP79621 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CiitaP79621 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CiitaP79621 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CiitaP79621 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CiitaP79621 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CiitaP79621 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CiitaP79621 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CiitaP79621 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CiitaP79621 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CiitaP79621 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CiitaP79621 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CiitaP79621 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CiitaP79621 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CiitaP79621 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CiitaP79621 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CiitaP79621 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CiitaP79621 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CiitaP79621 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms