Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Polr1bP70700 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Polr1bP70700 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms