Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rad50P70388 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad50P70388 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad50P70388 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rad50P70388 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rad50P70388 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Rad50P70388 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad50P70388 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rad50P70388 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms