Protein–RNA interactions for Protein: P70295

Aup1, Ancient ubiquitous protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aup1P70295 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Aup1P70295 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Aup1P70295 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Aup1P70295 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Aup1P70295 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Aup1P70295 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Aup1P70295 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Aup1P70295 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Aup1P70295 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Aup1P70295 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Aup1P70295 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Aup1P70295 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms