Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgif1P70284 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgif1P70284 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgif1P70284 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgif1P70284 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgif1P70284 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgif1P70284 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgif1P70284 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgif1P70284 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgif1P70284 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tgif1P70284 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgif1P70284 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgif1P70284 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgif1P70284 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgif1P70284 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgif1P70284 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgif1P70284 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgif1P70284 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgif1P70284 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgif1P70284 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgif1P70284 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgif1P70284 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgif1P70284 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgif1P70284 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tgif1P70284 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tgif1P70284 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tgif1P70284 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tgif1P70284 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms