Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Vamp7P70280 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vamp7P70280 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms