Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DccP70211 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
DccP70211 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DccP70211 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
DccP70211 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DccP70211 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DccP70211 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DccP70211 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DccP70211 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DccP70211 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
DccP70211 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DccP70211 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
DccP70211 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DccP70211 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DccP70211 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
DccP70211 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DccP70211 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DccP70211 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DccP70211 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
DccP70211 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
DccP70211 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DccP70211 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DccP70211 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
DccP70211 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DccP70211 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DccP70211 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
DccP70211 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
DccP70211 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
DccP70211 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
DccP70211 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DccP70211 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
DccP70211 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DccP70211 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
DccP70211 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
DccP70211 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DccP70211 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DccP70211 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DccP70211 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DccP70211 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
DccP70211 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DccP70211 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DccP70211 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DccP70211 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DccP70211 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DccP70211 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DccP70211 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DccP70211 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DccP70211 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DccP70211 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DccP70211 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
DccP70211 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DccP70211 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DccP70211 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DccP70211 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DccP70211 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DccP70211 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
DccP70211 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DccP70211 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
DccP70211 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
DccP70211 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DccP70211 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DccP70211 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DccP70211 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
DccP70211 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DccP70211 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
DccP70211 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DccP70211 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DccP70211 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
DccP70211 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
DccP70211 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DccP70211 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DccP70211 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DccP70211 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DccP70211 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
DccP70211 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DccP70211 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
DccP70211 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DccP70211 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DccP70211 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
DccP70211 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
DccP70211 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DccP70211 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
DccP70211 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DccP70211 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DccP70211 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DccP70211 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
DccP70211 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
DccP70211 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DccP70211 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
DccP70211 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DccP70211 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DccP70211 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DccP70211 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
DccP70211 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DccP70211 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DccP70211 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DccP70211 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DccP70211 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DccP70211 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
DccP70211 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms