Protein–RNA interactions for Protein: P63254

Crip1, Cysteine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crip1P63254 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crip1P63254 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crip1P63254 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Crip1P63254 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crip1P63254 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Crip1P63254 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crip1P63254 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Crip1P63254 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crip1P63254 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Crip1P63254 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crip1P63254 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Crip1P63254 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Crip1P63254 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms