Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vamp3P63024 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms