Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrch1P62046 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrch1P62046 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrch1P62046 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms