Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ufm1P61961 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ufm1P61961 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms