Protein–RNA interactions for Protein: P61622

Itga11, Integrin alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga11P61622 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga11P61622 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga11P61622 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga11P61622 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga11P61622 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga11P61622 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga11P61622 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga11P61622 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga11P61622 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga11P61622 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga11P61622 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga11P61622 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itga11P61622 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms