Protein–RNA interactions for Protein: P61164

Actr1a, Alpha-centractin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actr1aP61164 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Actr1aP61164 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Actr1aP61164 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms