Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nup43P59235 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nup43P59235 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nup43P59235 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nup43P59235 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nup43P59235 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup43P59235 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup43P59235 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup43P59235 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup43P59235 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup43P59235 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nup43P59235 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms