Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dpf3P58269 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dpf3P58269 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.33■■□□□ 1
Dpf3P58269 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dpf3P58269 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dpf3P58269 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dpf3P58269 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dpf3P58269 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Dpf3P58269 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms