Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tm9sf2P58021 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tm9sf2P58021 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tm9sf2P58021 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tm9sf2P58021 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tm9sf2P58021 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tm9sf2P58021 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tm9sf2P58021 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tm9sf2P58021 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tm9sf2P58021 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tm9sf2P58021 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tm9sf2P58021 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tm9sf2P58021 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tm9sf2P58021 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tm9sf2P58021 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tm9sf2P58021 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tm9sf2P58021 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tm9sf2P58021 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tm9sf2P58021 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tm9sf2P58021 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Tm9sf2P58021 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tm9sf2P58021 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tm9sf2P58021 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tm9sf2P58021 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tm9sf2P58021 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tm9sf2P58021 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tm9sf2P58021 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms