Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Snrpa1P57784 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Snrpa1P57784 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Snrpa1P57784 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms