Protein–RNA interactions for Protein: P56873

Sssca1, Sjoegren syndrome/scleroderma autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sssca1P56873 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sssca1P56873 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sssca1P56873 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms