Protein–RNA interactions for Protein: P56657

Cyp2c40, Cytochrome P450 2C40, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c40P56657 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyp2c40P56657 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cyp2c40P56657 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyp2c40P56657 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms