Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TdgP56581 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TdgP56581 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TdgP56581 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TdgP56581 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TdgP56581 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TdgP56581 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TdgP56581 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TdgP56581 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TdgP56581 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TdgP56581 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TdgP56581 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TdgP56581 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TdgP56581 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TdgP56581 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TdgP56581 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TdgP56581 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TdgP56581 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TdgP56581 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TdgP56581 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TdgP56581 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TdgP56581 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TdgP56581 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TdgP56581 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TdgP56581 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TdgP56581 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TdgP56581 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TdgP56581 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TdgP56581 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TdgP56581 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TdgP56581 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TdgP56581 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TdgP56581 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TdgP56581 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TdgP56581 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TdgP56581 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TdgP56581 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TdgP56581 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TdgP56581 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TdgP56581 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TdgP56581 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TdgP56581 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TdgP56581 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TdgP56581 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TdgP56581 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TdgP56581 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TdgP56581 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TdgP56581 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TdgP56581 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TdgP56581 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TdgP56581 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TdgP56581 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TdgP56581 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TdgP56581 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TdgP56581 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TdgP56581 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TdgP56581 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TdgP56581 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TdgP56581 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TdgP56581 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TdgP56581 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TdgP56581 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TdgP56581 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TdgP56581 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TdgP56581 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TdgP56581 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TdgP56581 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TdgP56581 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TdgP56581 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TdgP56581 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TdgP56581 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TdgP56581 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TdgP56581 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TdgP56581 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TdgP56581 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TdgP56581 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TdgP56581 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TdgP56581 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TdgP56581 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TdgP56581 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TdgP56581 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TdgP56581 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TdgP56581 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TdgP56581 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TdgP56581 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TdgP56581 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TdgP56581 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TdgP56581 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TdgP56581 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TdgP56581 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TdgP56581 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TdgP56581 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TdgP56581 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TdgP56581 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TdgP56581 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TdgP56581 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TdgP56581 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TdgP56581 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TdgP56581 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TdgP56581 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms