Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cd38P56528 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cd38P56528 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms