Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf5P56477 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Irf5P56477 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irf5P56477 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Irf5P56477 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Irf5P56477 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf5P56477 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf5P56477 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf5P56477 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf5P56477 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf5P56477 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Irf5P56477 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf5P56477 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms