Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Faf1P54731 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Faf1P54731 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Faf1P54731 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Faf1P54731 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Faf1P54731 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Faf1P54731 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms