Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rad23bP54728 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rad23bP54728 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms