Protein–RNA interactions for Protein: P53657

Pklr, Pyruvate kinase PKLR, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PklrP53657 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PklrP53657 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PklrP53657 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PklrP53657 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PklrP53657 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PklrP53657 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PklrP53657 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PklrP53657 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PklrP53657 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PklrP53657 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PklrP53657 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PklrP53657 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PklrP53657 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PklrP53657 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PklrP53657 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PklrP53657 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PklrP53657 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PklrP53657 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PklrP53657 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PklrP53657 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PklrP53657 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PklrP53657 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PklrP53657 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PklrP53657 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PklrP53657 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PklrP53657 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PklrP53657 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PklrP53657 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PklrP53657 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PklrP53657 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PklrP53657 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PklrP53657 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PklrP53657 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PklrP53657 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PklrP53657 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PklrP53657 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PklrP53657 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PklrP53657 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PklrP53657 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PklrP53657 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PklrP53657 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PklrP53657 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PklrP53657 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PklrP53657 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PklrP53657 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PklrP53657 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PklrP53657 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PklrP53657 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PklrP53657 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PklrP53657 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PklrP53657 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PklrP53657 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PklrP53657 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PklrP53657 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PklrP53657 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PklrP53657 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PklrP53657 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PklrP53657 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PklrP53657 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PklrP53657 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PklrP53657 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PklrP53657 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PklrP53657 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PklrP53657 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PklrP53657 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PklrP53657 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PklrP53657 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PklrP53657 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PklrP53657 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PklrP53657 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PklrP53657 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PklrP53657 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PklrP53657 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PklrP53657 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PklrP53657 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PklrP53657 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PklrP53657 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PklrP53657 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PklrP53657 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PklrP53657 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PklrP53657 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PklrP53657 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PklrP53657 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PklrP53657 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PklrP53657 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PklrP53657 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PklrP53657 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PklrP53657 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PklrP53657 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PklrP53657 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PklrP53657 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PklrP53657 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PklrP53657 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PklrP53657 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PklrP53657 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PklrP53657 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PklrP53657 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PklrP53657 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PklrP53657 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PklrP53657 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166.9 ms