Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna1P52793 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna1P52793 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna1P52793 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna1P52793 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Efna1P52793 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna1P52793 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna1P52793 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna1P52793 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna1P52793 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna1P52793 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna1P52793 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna1P52793 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna1P52793 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna1P52793 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna1P52793 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna1P52793 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna1P52793 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Efna1P52793 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna1P52793 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna1P52793 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna1P52793 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna1P52793 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Efna1P52793 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna1P52793 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna1P52793 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna1P52793 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Efna1P52793 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms