Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ube2e3P52483 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ube2e3P52483 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ube2e3P52483 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms