Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClgnP52194 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClgnP52194 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ClgnP52194 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ClgnP52194 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ClgnP52194 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ClgnP52194 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ClgnP52194 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ClgnP52194 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ClgnP52194 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ClgnP52194 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ClgnP52194 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ClgnP52194 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ClgnP52194 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ClgnP52194 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms